По происхождению грек (по другим предположениям, болгарин).

С 1077 года (по другим источникам, с 1080 года) – митрополит Киевский.

В сан митрополита возведен Константинопольским патриархом Николаем Грамматиком. Глубокое и всеобщее уважение заслужил митрополит Иоанн в Киеве. Замечательный отзыв о нем дал известный русский летописец преподобный Нестор († ок. 1114; память 27 октября/9 ноября). Он, восхищенный высокими качествами митрополита Иоанна, говорит, что «подобного ему еще не было на Руси да и не будет; это муж сведущий в книгах, искусный в учении, милостивый к убогим и вдовицам, ласковый ко всякому – богатому и бедному, смиренный и кроткий любитель молчания, владевший даром слова и утешавший святыми беседами печальных». В этой краткой характеристике перед нами встает замечательный облик святителя. Проследим эти характерные черты митрополита Иоанна на примерах его жизни. Искусный в книгах и учении, он был муж, по словам апостола, учителей. Он хорошо знал Священное Писание и каноны Святой Церкви. В учительстве своем святитель Иоанн следовал всецело учению святой Церкви, наставлял паству свою православным догматам и истинному благочестию. Причем характер его учительства отличался особой мягкостью, смиренным тоном и убедительностью. Таков его ответ на послание антипапы Климента III о церковном единстве. Важное значение в характере митрополита Иоанна занимает его милосердие в отношении к убогим и вдовицам. Оно выражалось в сочувствии бедствующим и нуждавшимся.

Кроме названных выше качеств святителя, его отличали и другие не менее важные: рассудительность в надзоре за архипастырями, пастырями и паствою. Выражалось это в усердном хранении нравственности, в соблюдении церковных канонов, в ревности с отсечением человекоугодия пред сильными мира сего, в благоговейном отношении к святыням церковным.

Таким образом, святитель Иоанн был истинным пастырем своего словесного стада. Его даже называли «пророком Христовым».

Впервые на Руси митрополит Иоанн стал носить белый клобук, потому что, как полагают историографы, святитель среди митрополитов домонгольского периода представлял собою явление выдающееся и даже исключительное. О его деятельности в епархии известно лишь то, что в 1086 году он основал храм святого апостола Андрея Первозванного в Андреевском монастыре; в 1087 году торжественно предал погребению тело убитого князя Ярополка Изяславича и освящал храм Михаила Архангела в Выдубицком монастыре; 14 августа 1089 года он освящал «чудную» – Великую церковь Печерскую в честь Успения Пресвятой Богородицы.

31 августа 1089 года митрополит Иоанн скончался.